Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfrO88507 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CntfrO88507 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfrO88507 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms