Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AvilO88398 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AvilO88398 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AvilO88398 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AvilO88398 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AvilO88398 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AvilO88398 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AvilO88398 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AvilO88398 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AvilO88398 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AvilO88398 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AvilO88398 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AvilO88398 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AvilO88398 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AvilO88398 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AvilO88398 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AvilO88398 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AvilO88398 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AvilO88398 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AvilO88398 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AvilO88398 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AvilO88398 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms