Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IkbkbO88351 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IkbkbO88351 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IkbkbO88351 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms