Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sorl1O88307 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sorl1O88307 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms