Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gfi1bO70237 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms