Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf5O70191 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atf5O70191 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf5O70191 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf5O70191 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf5O70191 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms