Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrna4O70174 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrna4O70174 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrna4O70174 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.8 ms