Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkbO55229 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkbO55229 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkbO55229 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkbO55229 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkbO55229 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkbO55229 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkbO55229 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkbO55229 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ChkbO55229 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkbO55229 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChkbO55229 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChkbO55229 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ChkbO55229 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChkbO55229 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChkbO55229 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChkbO55229 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChkbO55229 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms