Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp2a2O55143 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp2a2O55143 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms