Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap2O55126 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap2O55126 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms