Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nipsnap1O55125 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap1O55125 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap1O55125 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms