Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrxO55103 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrxO55103 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrxO55103 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrxO55103 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrxO55103 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrxO55103 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PrxO55103 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrxO55103 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrxO55103 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrxO55103 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrxO55103 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PrxO55103 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrxO55103 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrxO55103 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PrxO55103 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrxO55103 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrxO55103 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PrxO55103 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrxO55103 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrxO55103 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PrxO55103 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrxO55103 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrxO55103 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrxO55103 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrxO55103 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PrxO55103 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PrxO55103 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrxO55103 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PrxO55103 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrxO55103 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrxO55103 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrxO55103 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrxO55103 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PrxO55103 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PrxO55103 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PrxO55103 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PrxO55103 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PrxO55103 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrxO55103 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PrxO55103 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrxO55103 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrxO55103 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrxO55103 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PrxO55103 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrxO55103 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrxO55103 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrxO55103 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrxO55103 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrxO55103 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PrxO55103 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PrxO55103 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PrxO55103 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PrxO55103 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PrxO55103 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms