Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syngr2O55101 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syngr2O55101 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr2O55101 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms