Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trdmt1O55055 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trdmt1O55055 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trdmt1O55055 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms