Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc3O55013 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc3O55013 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms