Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bnip3O55003 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bnip3O55003 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnip3O55003 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnip3O55003 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms