Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema6bO54951 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema6bO54951 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms