Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TsksO54887 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TsksO54887 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TsksO54887 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TsksO54887 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TsksO54887 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TsksO54887 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TsksO54887 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TsksO54887 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TsksO54887 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TsksO54887 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TsksO54887 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TsksO54887 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TsksO54887 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TsksO54887 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TsksO54887 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TsksO54887 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TsksO54887 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TsksO54887 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TsksO54887 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TsksO54887 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TsksO54887 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TsksO54887 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TsksO54887 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TsksO54887 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TsksO54887 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TsksO54887 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TsksO54887 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TsksO54887 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TsksO54887 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TsksO54887 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TsksO54887 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TsksO54887 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TsksO54887 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TsksO54887 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TsksO54887 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TsksO54887 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TsksO54887 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TsksO54887 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TsksO54887 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TsksO54887 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TsksO54887 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TsksO54887 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TsksO54887 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms