Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Atp10aO54827 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp10aO54827 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp10aO54827 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp10aO54827 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms