Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limk2O54785 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Limk2O54785 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Limk2O54785 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms