Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek2O35942 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Nek2O35942 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Nek2O35942 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Nek2O35942 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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Nek2O35942 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Nek2O35942 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Nek2O35942 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Nek2O35942 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek2O35942 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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