Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops5O35864 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops5O35864 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops5O35864 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops5O35864 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops5O35864 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops5O35864 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms