Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptlc1O35704 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc1O35704 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc1O35704 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms