Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrt1O35449 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms