Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CrcpO35427 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CrcpO35427 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CrcpO35427 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CrcpO35427 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CrcpO35427 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms