Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn1O35350 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn1O35350 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn1O35350 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn1O35350 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn1O35350 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms