Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kpna3O35344 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Kpna3O35344 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms