Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srsf5O35326 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srsf5O35326 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms