Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx3O35160 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pitx3O35160 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms