Protein–RNA interactions for Protein: O08934

Uncx, Homeobox protein unc-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UncxO08934 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UncxO08934 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UncxO08934 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UncxO08934 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UncxO08934 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UncxO08934 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UncxO08934 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UncxO08934 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UncxO08934 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UncxO08934 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UncxO08934 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UncxO08934 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UncxO08934 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UncxO08934 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UncxO08934 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UncxO08934 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UncxO08934 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UncxO08934 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UncxO08934 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UncxO08934 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UncxO08934 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UncxO08934 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UncxO08934 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UncxO08934 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UncxO08934 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UncxO08934 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UncxO08934 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UncxO08934 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UncxO08934 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UncxO08934 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UncxO08934 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UncxO08934 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UncxO08934 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UncxO08934 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UncxO08934 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UncxO08934 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UncxO08934 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UncxO08934 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UncxO08934 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UncxO08934 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UncxO08934 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UncxO08934 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UncxO08934 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UncxO08934 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UncxO08934 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UncxO08934 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UncxO08934 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UncxO08934 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UncxO08934 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UncxO08934 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UncxO08934 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UncxO08934 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UncxO08934 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UncxO08934 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UncxO08934 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UncxO08934 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UncxO08934 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UncxO08934 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UncxO08934 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UncxO08934 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UncxO08934 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UncxO08934 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UncxO08934 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UncxO08934 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UncxO08934 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UncxO08934 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UncxO08934 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UncxO08934 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UncxO08934 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UncxO08934 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UncxO08934 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UncxO08934 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UncxO08934 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UncxO08934 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UncxO08934 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UncxO08934 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UncxO08934 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UncxO08934 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms