Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eftud2O08810 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eftud2O08810 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eftud2O08810 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms