Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Dctn1O08788 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dctn1O08788 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dctn1O08788 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms