Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3aO08759 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3aO08759 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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