Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm379J3QQ19 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Gm379J3QQ19 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Gm379J3QQ19 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Gm379J3QQ19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Gm379J3QQ19 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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Gm379J3QQ19 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm379J3QQ19 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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