Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5108J3QP01 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5108J3QP01 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms