Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17535J3KMR8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17535J3KMR8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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