Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21719J3KMI9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21719J3KMI9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21719J3KMI9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms