Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r67G5E8C1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms