Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2b1G5E829 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms