Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r34G3XA52 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r34G3XA52 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms