Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933406M09RikG3XA12 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms