Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcf11G3X9Z4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Pcf11G3X9Z4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pcf11G3X9Z4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms