Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms