Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc9a3G3X939 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc9a3G3X939 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc9a3G3X939 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms