Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17455G3UW87 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm17455G3UW87 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms