Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r167G3UW71 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms