Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp72F8VQC1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Srp72F8VQC1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms