Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NpcdF8VQB8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NpcdF8VQB8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms