Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ScaperF8VQ70 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ScaperF8VQ70 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ScaperF8VQ70 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ScaperF8VQ70 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms