Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp9yF8VPU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms